Grant Reuma
Grant Reuma - €50.000
Decodering van de T-cel receptor repertoire en genexpressiepaden bij polymyalgia rheumatica en giant cell arteritis met behulp van machine learning-algoritmen
Prof. dr. Benson Ogunjimi
Polymyalgia rheumatica (PMR) en arteritis temporalis (GCA) zijn twee nauw verwante systemische ontstekingsziekten die respectievelijk het bewegingsapparaat en middelgrote tot grote slagaders aantasten. Er is weinig bekend over de onderliggende pathofysiologie van PMR en de bestaande kennis geeft aan dat CD4+ T-cellen waarschijnlijk van groot belang zijn bij PMR.
Om ons begrip van de pathofysiologie van PMR te vergroten, zullen we bulk T-celreceptor (TCR)-gegevens verkrijgen van verschillende T-cel typen van PMR-patiënten, GCA-patiënten, gezonde controles en zieke controles (patiënten met psoriatische artritis). T-cellen 'herkennen' hun antigene doelen en interacteren ermee via de TCR op hun oppervlak. Via onze machine learning-tools zullen we ziektespecifieke TCR-clusters kunnen identificeren. Vervolgens zullen we deze "TCR-vingerafdrukken" gebruiken om transcriptomics & TCR-gegevens te analyseren en de genexpressiepaden van geactiveerde CD4+ T-cellen tussen de verschillende groepen te vergelijken, waardoor we unieke inzichten genereren in hoe CD4+ T-cellen in PMR (en GCA) ontregeld zijn. Tot slot zullen we onze bloedafgeleide TCR-clusters voor GCA valideren door TCR-sequencing uit te voeren op eerder verkregen GCA-weefselbiopsieën.
Dit project zal niet alleen een broodnodige vooruitgang in ons begrip van de pathofysiologie van PMR,genereren, maar kan ook leiden tot de ontwikkeling van nieuwe PMR-specifieke therapieën.
